华南农业大学是一所以农学为主的综合性大学，其专业设置涵盖了农学、林学、动物科学、植物保护、食品科学与工程、农业工程、农业经济管理、园艺、草业科学、水土保持等多个学科门类。
农学专业是华南农业大学的传统专业，其主要研究内容包括农业生物学、农业生态学、农业植物学、农业动物学、农业土壤学、农业水利学、农业植物保护学、农业机械学、农业经济学、农业社会学等。该专业培养学生具备农业科学知识和技能，能够在农业生产、科研、教育、管理等领域从事农业科学研究、教学、管理和技术服务工作的高级专门人才。
林学专业是华南农业大学的重点专业，其主要研究内容包括森林生态学、森林经营学、森林保护学、森林采伐学、森林病虫害学、森林资源统计学、森林植物学、森林土壤学、森林水文学、森林放牧学、森林野生动物学等。该专业培养学生具备森林科学知识和技能，能够在森林资源管理、森林保护、森林采伐、森林病虫害防治、森林放牧、森林野生动物保护等领域从事森林科学研究、教学、管理和技术服务工作的高级专门人才。
动物科学专业是华南农业大学的特色专业，其主要研究内容包括动物遗传育种学、动物繁殖学、动物营养学、动物病理学、动物行为学、动物生理学、动物病害防治学、动物药学、动物禽畜经济学、动物禽畜管理学等。该专业培养学生具备动物科学知识和技能，能够在动物遗传育种、动物繁殖、动物营养、动物病理、动物行为、动物生理、动物病害防治、动物药学、动物禽畜经济、动物禽畜管理等领域从事动物科学研究、教学、管理和技术服务工作的高级专门人才。
植物保护专业是华南农业大学的新兴专业，其主要研究内容包括植物病理学、植物病害防治学、植物药学、植物检疫学、植物生物技术、植物病虫害防治学、植物病虫害生物学、植物病虫害生态学、植物病虫害化学防治学等。该专业培养学生具备植物保护科学知识和技能，能够在植物病理、植物病害防治、植物药学、植物检疫、植物生物技术、植物病虫害防治、植物病虫害生物学、植物病虫害生态学、植物病虫害化学防治等领域从事植物保护科学研究、教学、管理和技术服务工作的高级专门人才。
食品科学与工程专业是华南农业大学的新兴专业，其主要研究内容包括食品科学、食品工程、食品营养学、食品安全学、食品微生物学、食品分析学、食品加工学、食品包装学、食品质量控制学
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