上海科技大学是一所以工科为主，理工科为辅的综合性大学，其专业设置也是以工科为主，理工科为辅，涵盖了多个学科领域。
上海科技大学的专业设置主要包括：工程学院、管理学院、信息学院、艺术学院、环境与资源学院、生命科学学院、医学院、外国语学院、数学学院、物理学院、化学学院、材料学院、计算机学院、电子学院、经济学院、法学院、公共管理学院、新闻与传播学院、体育学院、国际学院等。
其中，工程学院下设有机械工程、电子信息工程、自动化、计算机科学与技术、材料科学与工程、环境工程、能源与动力工程、测控技术与仪器、电气工程及其自动化、土木工程、化学工程与工艺、船舶与海洋工程、核工程与核技术、石油工程、交通运输工程、飞行器制造工程、工业设计等专业。
管理学院下设有工商管理、会计学、市场营销、人力资源管理、物流管理、电子商务、信息管理与信息系统、房地产经营管理、国际商务、经济学、金融学、社会工作、公共事业管理等专业。
信息学院下设有计算机科学与技术、网络工程、软件工程、信息安全、物联网工程、数据科学与大数据技术、空间信息与数字技术、移动应用开发、网络与新媒体等专业。
艺术学院下设有视觉传达设计、产品设计、动画、影视制作、游戏设计、艺术设计、环境设计、服装设计、美术学、音乐学、舞蹈学等专业。
环境与资源学院下设有环境科学与工程、资源环境与城乡规划管理、地理信息科学、生态学、海洋科学、农业资源与环境、食品科学与工程、食品营养与检验教育等专业。
生命科学学院下设有生物技术、生物信息学、生物医学工程、生物科学、生物化学与分子生物学、生物资源与环境、生物科学与技术教育等专业。
医学院下设有临床医学、口腔医学、预防医学、中医学、药学、护理学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗学、医学实验技术等专业。
外国语学院下设有英语、日语、德语、法语、俄语、西班牙语、阿拉伯语、汉语言文学、外国语言学及应用语言学等专业。
数学学院下设有数学与应用数学、信息与计算科学、统计学、金融数学、数学教育等专业。
物理学院下设有应用物理学、核物理学、光学工程、物理学、物理教育等专业。
化学学院下设有应用化学、分子科学与工程、化学、化学教育等专业。
材料学院下设有材料科学与工程、材料物理、材料化学、材料加工工程、材料教育等专业。
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